春秋战国时期，随着生产力的发展，社会经历了剧变，文化和卫生保健也受到了影响，诸子百家学说开始蓬勃发展。在医学领域，《黄帝内经》系统地总结并提出了气功的基本原则和方法，将气功列为首要的养生治疗方法。儒家提出了专注意念、用心倾听，然后心灵休息和气融合的儒家气功方法；道家的老子和庄子主张顺应自然规律，用“去物欲以养形，致虚静以养神”和“形神不亏，便可长生”等养生方法。这些学说与当时医学气功的发展相互协调并影响着彼此。至于佛教，一般认为它是在汉朝佛教传入中国后才出现的。在佛教中，没有类似气功这个概念，但藏传佛教的无上瑜伽中有类似练气的术语和修炼方法，但在汉地佛教界并不广泛流传。从佛教的传统观点和一般佛教徒的信仰立场来看，佛教的禅定与气功有所不同；然而客观地看，佛教中也包含一些类似气功的内容，特别是“明心见性”的理论和实践，对后来气功的发展产生了很大影响。在宋明理学派中，致力于整合儒、释、道三大学派的理论，气功发展出了各种各样的方法，使气功养生的理论和技术变得更加完善和系统。
中国古代的武术主要用于健身和技击。各派武术中的健身方法，尤其是站桩法中包含了类似气功的内容；气功和武术在某些方法上也互相影响。例如，现代健身中的站桩功法中，很多就来自武术，而武术也吸取了一些气功的理论和方法。武术界有句格言："练武不练功（气），到老一场空"，可见两者之间是相关的。