1.加重高血压
咖啡因本身具有止痛作用，常与其他简单的止痛剂合成复方。但是，长期大量服用咖啡因会加剧高血压。咖啡因能使血压上升，如果再加上情绪紧张，就会产生危险性的相乘效果。因此，高血压的危险人群应尤其避免在工作压力大的时候喝含咖啡因的饮料。
有些长期喝咖啡的人认为自己对咖啡因已经免疫，然而事实并非如此。一项研究显示，喝一杯咖啡后，血压升高的时间可长达12小时。
2.诱发骨质疏松
咖啡因具有利尿效果。如果长期大量喝咖啡，容易造成骨质流失，对骨量的保存会有不利的影响。对于妇女来说，可能会增加骨质疏松的风险。
但前提是，平时食物中本来就缺乏摄取足够的钙，或是不经常运动的人，加上更年期后的女性，因缺少雌激素造成的钙质流失。以上这些情况再加上大量的咖啡因，才可能对骨骼造成威胁。如果能够按照合理的量来享受，你还是可以做到不因噎废食的。
3.过量会造成神经过敏
咖啡因在紧张时有助于提高警觉性、灵敏性、记忆力及集中力。但是，饮用超过平常所习惯的咖啡量，就会产生类似食用相同剂量的兴奋剂的效果，会造成神经过敏。
对于倾向焦虑失调的人而言，咖啡因会导致手心冒汗、心悸、耳鸣等症状加剧。